Первая семинарская Троицкая церковь устроена в 1829 на 3-м этаже семинарского здания, в 1861 перенесена в другое помещение. После перестройки семинарского здания в 1876-1877 обновлена и переосвящена как Софийская. В 1898 вновь перенесена в новую пристройку к прежнему зданию, отмечена главой, освящена 5 окт. 1899. Закрыта после 1917, занята воинской частью, затем школой-интернатом. В 2001 здание возвращено семинарии, восстановлена главка, но храм устроен в новой постройке и освящён как Троицкий.